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腫瘤基因檢測助力精準癌癥預防治療

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作為世界上最好的癌癥中心之一,比弗利山莊癌癥中心(BHCC)在癌癥預防、診斷、治療、護理等各領域都走在國際前列!BHCC致力于精準癌癥醫療的實施,通過與多家權威的腫瘤基因檢測機構合作,利用先進的腫瘤基因檢測技術和大數據分析能力為癌癥患者提供高等級的醫學循證依據,實現精準的癌癥風險評估、類別診斷、治療優化等。其中,美國最大的臨床實驗室之一“ GenPath ”就是BHCC的重要合作伙伴之一。

GenPath是一個由CLIA和CAP認證的國家腫瘤診斷實驗室,在癌癥診斷技術方面無與倫比,可為癌癥患者提供完整的疾病檢測,包括從常規臨床檢測、特殊凝固測試到針對腫瘤基因序列及遺傳性癌癥綜合征的復雜基因組檢測。

 

基因檢測,遺傳性基因綜合癥

 

GenPath遺傳性癌癥基因檢測——防癌,從基因開始

越來越多的基因變異被證實與各種形式的癌癥有關聯,GenPath 的遺傳性癌癥基因檢測服務(Hereditary Cancer Panels),不局限于BRCA(乳腺癌易感基因),而是提供更為廣泛的癌癥基因檢測項目,以滿足不同個體的需求。至今已有超過45000人通過GenPath來檢測有害的基因變異——那些可加大患癌風險的變異。

(備注:基因Panel是指將若干基因對應的探針設計到同一張捕獲芯片上以捕獲目標DNA并用于后續的基因測序)

據ACOG統計,近三年歐美國家的癌癥發病率和死亡率明顯下降,許多潛在的癌癥“候選人”,尤其是有癌癥家族史的人群,通過進行遺傳性癌癥基因檢測,精確獲悉了相關癌癥的患病幾率和預防建議,提前采取了預防措施,從而避免癌癥侵襲,例如乳腺癌預防性切除使得高癌風險患者發病率下降了60%,卵巢癌發病率下降了85%。

值得一提的是,GenPath針對中國民眾提供遠程檢測服務,基因檢測試劑盒可在美國下單后托運回國進行遠程基因檢測,1個月后通過遠程視頻會診獲取最終的基因檢測結果和專業評估建議。

GenPath第二代基因測序,實現精準癌癥醫療

GenPath 實驗室的細胞遺傳學博士Robert Daber帶領了一支精銳科研團隊,設計出了一項專利技術——OnkoSight,用于惡性血液病和實體腫瘤的二代基因測序,旨在為患者制定精準的癌癥治療及管理方案。基于二代測序的OnkoSight Panels 所涵蓋的基因項目具備明確的治療價值、診斷價值或預后價值,并與末期臨床試驗適用性相關,每個腫瘤特殊Panel都包含了美國國立綜合癌癥網絡(NCCN)推薦的基因。

 

onkosight,精準基因檢測

 

通過OnkoSight 基因Panels檢測可以對癌癥患者進行精準診斷和精準分型,確認對治療具有重要指導意義的基因突變,包括FDA批準的腫瘤治療藥物的作用靶點,以及正在進行的腫瘤臨床試驗的藥物靶點,為后續治療提供重要參考,也幫助某些患者匹配到適合的臨床試驗。

OnkoSight基因Panels檢測僅限在美國本土進行,技術流程如下:

 

OnkoSight操作流程,技術流程

 

1、組織提取

對于實體腫瘤,GenPath實驗室分塊檢索部門將協調所有OnkoSight病例標本的檢索,并確保分塊返回。

2、組織復查

針對實體腫瘤,將由GenPath一名分子病理學家核查所有病例的每張H&E幻燈片以確保:①腫瘤存在;②腫瘤細胞核占細胞> 10%;③組織檢測部分是最適宜的。

3、DNA離析

對于實體腫瘤,將樣本溫育過夜以增加FFPE組織的DNA產量。對于小樣本,GenPath實驗室將延長溫育時間以最大程度提高從樣本分離的DNA數量。

4、DNA質量控制

對于實體腫瘤來說,組織固定可以破壞DNA結構。許多競爭對手對所有標本制作了基因Panel卻忽視了DNA的質量。從另一方面來說,GenPath公司設計了嚴格的質量控制體系來確保DNA的質量,且數量上就足以提高總成功率。如果GenPath的科學家們認為DNA數量不足,將會于測試早期與客戶進行溝通。

5、庫制備

對于實體瘤檢測,GenPath實驗室創建了一項專門的技術,并且已進行過優化,以此解決DNA的低輸入量問題。

這些自定義庫為GenPath實驗室提供方案,用以解決小份且質量較差的標本,同時為創建現有測試產品提供了靈活的空間。

6、測序

OnkoSight骨髓疾病和實體瘤基因Panel將在Illumina公司平臺進行測序。這項技術保證了基因插入和基因刪除上較低的假陽性率,且從兩個方向上對每個DNA分子進行測序,相比其他競爭性產品的單個測序方向來說提高了精確度。

7、生物信息學

GenPath生物信息學通過ClearView分析學進行傳遞,后者為一套專門從定序器上讀取數以百萬計基因突變的演算法。ClearView分析學是由臨床醫生設計的,經由嚴謹的質量體系以提高OnkoSight的精確性,并減少報告生成的假陰性。大多數實驗室使用現成的基因Panel和生物信息學軟件;然而沒有專門的標準來驗證上述信息學結果的精確性。

8、報告生成

OnkoSight報告旨在為優化患者管理提供臨床相關信息。報告將會明確歸類為異常(ABNORMAL)、正常(NORMAL)、變化(VARIANT)或者意義不明(UNKNOWN SIGNIFICANCE)。

ClearView分析學監測到的每個變化值將由動態知識庫加以注釋。每天晚上,此數據庫將與NCCN指南、預后關聯分析、可行治療和臨床試驗保持同步更新,以保證GenPath生成最新報告且具有可行性。臨床試驗的選定也是依據腫瘤患者出現的特定基因突變。

9、Onkosight門戶網站

每個訪問Onkosight的客戶同樣可以訪問Onkosight醫生門戶網站,以此來訪問自己的基因Panel以監測患者基因檢測結果。通過OnkoSight醫生門戶網站,醫生可以搜索報告和參考文獻,并對臨床試驗進行實時匹配。

10、人群分析

由于可以與所有患者人群相聯系,醫生還可通過OnkoSight門戶網站追蹤患者結果。運用專門的分析工具,醫生可以很容易地確定患者是否符合新臨床試驗入組標準。GenPath公司同樣樂意與客戶相關的項目和出版物共同合作。

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